Vidi fonton por Molekula mekaniko

'''Molekula Mekaniko''' estas metodaro kiun oni kelkfoje kvalifikas kiel branĉo kaj de [[Teoria kemio|Teoria Kemio]] kaj de [[Komputika kemio|Komputika Kemio]]. Ĝi, per uzo de la [[Klasika mekaniko|Klasika Mekaniko]] klopodas modelumi molekulajn sistemojn. La [[Potenciala energio|Potencialan energio]]n de ĉiu ajn sistemo oni kalkulas per [[fortokampo]]j. Molekula Mekaniko povas esti uzata por pristudi kaj malgrandajn molekulojn kaj gradegajn biologiajn sistemojn.

Ĉiu Molekula Mekaniko-Metodo havas la jenajn ecojn:
* Ĉiu atomo estas modelumata kvazaŭ ĝi estu simpla [[partikulo]].
* Ĉiun partikulon oni asignas [[radiuso]]n (ofte la [[Radiuso de van der Waals]]) kaj konstantan netan [[ŝargo]]n (ĝenerale atingataj el kvantumaj kalkuloj <sup>kaj</sup>/<sub>aŭ</sub> eksperimentoj).
* Kemiajn ligojn oni vidas kiel "risortaro" kies ekvilibra distanco egalas al la eksperimenta aŭ kalkulita ligolongo.
[[Dosiero:Bond stretching energy.svg|eta|dekstra|Oni uzas [[fortokampo]]n por minimumigi la ligan plilongigan energion de ĉi tiu etana molekulo.]]

== Potenciala Energio-Funkcio ==
La jenan matematikan esprimon oni konas en la Komputika Kemia fako kiel '''''Potenciala Energio-Funkcio''''' aŭ '''''[[fortokampo|Fortokampo]]''''':

<math>\ E = E_\text{kovalenta} + E_\text{nekovalenta} \, </math>

kie la kontribuoj '''kovalenta''' kaj '''nekovalenta''' samtempe egalas al:

<math>\ E_\text{kovalenta} = E_\text{ligo} + E_\text{ligoangulo} + E_\text{duedrangulo} \, </math>

<math>\ E_\text{nekovalenta} = E_\text{kulomba} + E_\text{van der Waals} \, </math>

Ĉi tial, oni havas entute la jenan [[fortokampoj|Fortokampo]]n:

<math>\ E = E_\text{ligo} + E_\text{ligoangulo} + E_\text{duedrangulo} + E_\text{kulomba} + E_\text{van der Waals} \, </math>

[[Kategorio:Molekula fiziko]]
[[Kategorio:Komputa kemio]]